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Je m'intéresse à la modélisation des processus biologiques, et plus particulièrement à la conception de modèles mathématiques ayant une application dans le domaine de l'oncologie. Ce champ de recherche fait appel à un large éventail de méthodes et d'outils mathématiques portant sur l'analyse des EDO ou des EDP, l'analyse numérique, les probabilités ou encore la statistique. Mes travaux de recherche se situent donc à l'interface de deux domaines scientifiques : les mathématiques et la médecine​. Ils visent à éclairer la recherche médicale en améliorant la connaissance sur le fonctionnement des mécanismes biologiques d'intérêt et/ou la précision des méthodes mathématiques permettant le diagnostic de la maladie afin d'affiner la prise en charge thérapeutique et de promouvoir la personnalisation médicale. 

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Mes domaines de compétences sont les suivants :

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  • Modélisation basée sur les données (EDO, EDP)

  • Estimation de paramètres et calibration de modèles mathématiques

  • Simulation numérique

  • Analyse de données et maching learning

Manuscrit de thèse

Modélisation dynamique de la régulation de la voie RAF-RAS-MEK-ERK​ dans les cellules du carcinome hépatocellulaire exposées au sorafenib, Université de Picardie Jules Verne, 2019. lien

Publications

  • AS Giacobbi, Y. Mammeri, A. Galmiche, Mathematical optimization highlights a combination therapy of sorafenib with trametinib in hepatocellular carcinoma cells. En préparation.

Revues internationales à comité de lecture
  • S. Zaidak, AS Giacobbi, M. Chenda Ly, Y. Mammeri, A. Galmiche, La modélisation mathématique, un outil essentiel pour améliorer le ciblage thérapeutique des tumeurs solides, Med Sci (Paris), 33 12 (2017), 1055-1062, 2017. lien

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  • S. Zaidak*, AS Giacobbi*, C. Louandre, C. Sauzay, Y. Mammeri, A. Galmiche, Mathematical modelling unveils the essential role of cellular phosphatases in the inhibition of RAF-MEK-ERK signalling by sorafenib in hepatocellular carcinoma cells, Cancer Letters, 392 1-8, 2017. lien

      * partage le 1er auteur.

Acte de congrès international à comité de lecture
  • AS. Giacobbi, Y. Mammeri, A. Galmiche, Modelling of the ERK pathway in hepatocellular carcinoma cells exposed to sorafenib, European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB) 2018.

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  • AS. Giacobbi, Y. Mammeri, A. Galmiche, Modelling of the ERK pathway in liver cancer, ECMTB 2016.

Communications scientifiques

Conférences nationales et internationales

Communications orales

  • ECMTB 2018, Lisbonne, Portugal, 2018

  • SIMBios, Madère, Portugal, 2017

  • SMAI 2017, Ronce-les-Bains, 2017

  • ECMTB 2016, Nottingham, Royaume-Uni, 2016

Communications poster

  • Journée de la Fédération ARC, Amiens, 2016

  • Ecole d'été EDP et Probabilités en Biologie, CIRM, Marseille, 2016

  • 9ème Journée Scientifique du Cancéropôle Nord-Ouest, Deauville, 2016

  • 43ème Congrès d'Analyse Numérique, Obernai, 2016

Invitations aux séminaires
  • Séminaire MONC, Inria Bordeaux Sud-Ouest, 2019

  • Séminaire Gaussbusters, IRMAR, Université de Rennes, 2017

  • Séminaire Inriabcd, équipe DRACULA, Inria Lyon, 2017

  • Séminaires des doctorants, LMR, Université de Reims, 2016

  • Séminaire des doctorants, LAMFA, Université de Picardie Jules Verne, Amiens, 2016

Témoignage

Expérience de la SEME 2018 à Lille, Forum Emploi Maths, Cité des Sciences et de l'industrie, Paris, 2018.​

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