Je m'intéresse à la modélisation des processus biologiques, et plus particulièrement à la conception de modèles mathématiques ayant une application dans le domaine de l'oncologie. Ce champ de recherche fait appel à un large éventail de méthodes et d'outils mathématiques portant sur l'analyse des EDO ou des EDP, l'analyse numérique, les probabilités ou encore la statistique. Mes travaux de recherche se situent donc à l'interface de deux domaines scientifiques : les mathématiques et la médecine​. Ils visent à éclairer la recherche médicale en améliorant la connaissance sur le fonctionnement des mécanismes biologiques d'intérêt et/ou la précision des méthodes mathématiques permettant le diagnostic de la maladie afin d'affiner la prise en charge thérapeutique et de promouvoir la personnalisation médicale.
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Mes domaines de compétences sont les suivants :
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Modélisation basée sur les données (EDO, EDP)
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Estimation de paramètres et calibration de modèles mathématiques
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Simulation numérique
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Analyse de données et maching learning
Manuscrit de thèse
Modélisation dynamique de la régulation de la voie RAF-RAS-MEK-ERK​ dans les cellules du carcinome hépatocellulaire exposées au sorafenib, Université de Picardie Jules Verne, 2019. lien
Publications
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AS Giacobbi, Y. Mammeri, A. Galmiche, Mathematical optimization highlights a combination therapy of sorafenib with trametinib in hepatocellular carcinoma cells. En préparation.
Revues internationales à comité de lecture
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S. Zaidak, AS Giacobbi, M. Chenda Ly, Y. Mammeri, A. Galmiche, La modélisation mathématique, un outil essentiel pour améliorer le ciblage thérapeutique des tumeurs solides, Med Sci (Paris), 33 12 (2017), 1055-1062, 2017. lien
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S. Zaidak*, AS Giacobbi*, C. Louandre, C. Sauzay, Y. Mammeri, A. Galmiche, Mathematical modelling unveils the essential role of cellular phosphatases in the inhibition of RAF-MEK-ERK signalling by sorafenib in hepatocellular carcinoma cells, Cancer Letters, 392 1-8, 2017. lien
* partage le 1er auteur.
Acte de congrès international à comité de lecture
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AS. Giacobbi, Y. Mammeri, A. Galmiche, Modelling of the ERK pathway in hepatocellular carcinoma cells exposed to sorafenib, European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB) 2018.
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AS. Giacobbi, Y. Mammeri, A. Galmiche, Modelling of the ERK pathway in liver cancer, ECMTB 2016.
Communications scientifiques
Conférences nationales et internationales
Communications orales
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ECMTB 2018, Lisbonne, Portugal, 2018
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SIMBios, Madère, Portugal, 2017
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SMAI 2017, Ronce-les-Bains, 2017
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ECMTB 2016, Nottingham, Royaume-Uni, 2016
Communications poster
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Journée de la Fédération ARC, Amiens, 2016
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Ecole d'été EDP et Probabilités en Biologie, CIRM, Marseille, 2016
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9ème Journée Scientifique du Cancéropôle Nord-Ouest, Deauville, 2016
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43ème Congrès d'Analyse Numérique, Obernai, 2016
Invitations aux séminaires
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Séminaire MONC, Inria Bordeaux Sud-Ouest, 2019
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Séminaire Gaussbusters, IRMAR, Université de Rennes, 2017
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Séminaire Inriabcd, équipe DRACULA, Inria Lyon, 2017
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Séminaires des doctorants, LMR, Université de Reims, 2016
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Séminaire des doctorants, LAMFA, Université de Picardie Jules Verne, Amiens, 2016
Témoignage
Expérience de la SEME 2018 à Lille, Forum Emploi Maths, Cité des Sciences et de l'industrie, Paris, 2018.​